Уникальный дизайн появился в переломный момент истории страны. 27 апреля 1994 года флаг подняли в День свободы — когда в ЮАР прошли первые демократические выборы с участием граждан всех рас.
Новый флаг пришёл на смену оранжево-бело-синему символу 1928 года, который ассоциировался с эпохой апартеида и властью белого меньшинства. Для объединения нации требовался иной символ.
В 1993 году Комиссия по национальным символам объявила публичный конкурс на дизайн флага, который вызвал колоссальный интерес. Многоцветная композиция стала визуальным воплощением рождения новой ЮАР и её многонационального единства.